人類ゲノムの解読:生命の設計図を明らかにする競争
要約
人類ゲノムプロジェクトは、世界最大の生物学的共同研究で、公的資金30億ドルをかけて15年間で人類ゲノム全体をシークエンスすることを目的としていました。しかし、計画完了の7年前に、セレラという民間企業が同じ目標を3年で達成し、コストも格段に抑えられると発表しました。2つの陣営は、遺伝子の所有権に関する法的・倫理的問題で意見が分かれ、競争が始まりました。人類ゲノムプロジェクトの厳密なマップベースのアプローチは、セレラのリスキーな全ゲノムショットガンシークエンシングと対照的でした。プロジェクトは成功し、現在、人のゲノムを数日でシークエンスすることができます。しかし、ゲノムを読み解くことは最初のステップにすぎず、私たちのほとんどの遺伝子が何をしているか、どのように制御されているかを理解するにはまだ遠い道のりが残されています。
目次
- 人類ゲノムプロジェクトとセレラ
- 戦略とアプローチ
- ショットガンシークエンシング
- ゴールラインへの競争
- ゲノムプロジェクトの現在の影響
人類ゲノムプロジェクトとセレラ
Q:人類ゲノムプロジェクトとは何ですか?
A:人類ゲノムプロジェクトは、公的資金30億ドルをかけた20の研究センターの国際協力で、15年間で人類ゲノム全体を解読することを目的としていました。
Q:セレラとは何で、人類ゲノムプロジェクトとどのように異なりますか?
A:セレラは、人類ゲノムを3年でシークエンスし、コストを大幅に抑えることができると主張した民間企業です。彼らは彼らのデータを非公開にし、シークエンシングに異なるアプローチを取っていました。
戦略とアプローチ
Q:人類ゲノムプロジェクトは、どのようにゲノムのシークエンシングに取り組みましたか?
A:人類ゲノムプロジェクトは、まずゲノムをより管理しやすい小さな塊に分割し、それらを細菌人工染色体に挿入しました。これらの断片はクローン化され、指紋が付けられ、ゲノム内の各断片の場所が示された連続的なマップが作成されました。クローン化された断片は、プロジェクトの協力原則に従って世界中の研究所でシークエンスされました。
Q:セレラは、どのようにゲノムのシークエンシングに取り組みましたか?
A:セレラは、全ゲノムショットガンシークエンシングと呼ばれる方法を使用しました。ゲノムを小さな重なり合うピースに切り刻み、直接シークエンスしました。彼らはマッピングの段階をスキップし、オーバーラップだけを使ってゲノムを再構築するという恐るべきリスクを取りました。
ショットガンシークエンシング
Q:ショットガンシークエンシングとは何ですか?
A:ショットガンシークエンシングは、ゲノムを小さな断片に切り分け、それらをシークエンスするDNAシークエンシング方法です。重なり合うシークエンスを使用して、全ゲノムを再構築します。
Q:ショットガンシークエンシングの利点と欠点は何ですか?
A:ショットガンシークエンシングの利点は、他の方法よりも速く、安価であることです。欠点は、人間のゲノムのように多くの繰り返し部分を持つゲノムでは、誤ったアセンブリを引き起こす可能性があることです。
ゴールラインへの競争
Q:人類ゲノムのシークエンシングの競争に勝ったのは誰ですか?
A:人類ゲノムプロジェクトとセレラは、2001年2月に両方とも人類ゲノムの90%以上の作業用ドラフトを同時に公表しました。
Q: